토카이도 신간선「희망」의 경우, 도쿄도 구내-나고야시내는 자유석 10360엔(현행비+290원), 지정석 11090엔(현행비+310엔)이 된다.또, 도쿄도 구내-오사카시내는 자유석 13620엔(+380엔), 지정석 11450엔(+400엔)이 된다.
JR토카이 등 5사가 10엔 조각으로의 균일 운임을 신청한 것에 대해, JR동일본만이 1엔 조각과 10엔 조각의 이중 운임을 신청했다.

JR동일본에서는,종이의 표를 사용하는 경우의 최초구간을 일률 140엔, IC카드(정기권 사용을 제외하다)를 사용하는 경우의 최초구간을 133엔 또는 144엔으로 한다.

이와 같이, JR동일본에서는 종이의 표와 Suica 등 IC카드(정기권 사용을 제외하다)로 운임을 별체계로 한다.이것에 의해, 구간에 의해서 어느 쪽인지가 싸지거나 높아지거나 하게 된다.

도쿄 주변의 전철 특정 구간・야마노테선 에리어(보라색으로 가리킨 역)에서는, 어떠한 경우에서도 IC카드(정기권 사용을 제외하다)가 싸진다.한편, 도쿄 교외나 센다이 지구나 니가타 지구를 포함해 간선・지방 교통선에리어에서는 승차 구간에 의해서, 운임의 역전이 발생한다.

운임의 역전 현상은, 전철 특정 구간・야마노테선내 에리어에서는 종이의 표의 운임을「절상」것의, 간선・지방 교통선에리어에서는 종이의 표의 운임을「사사오입」하기 위해서 발생한다.

JR동일본에서는, 「신쥬쿠(전철 특정 구간 에리어)로부터 쇼우난 신쥬쿠 라인등에서 오미야(전철 특정 구간 에리어와 간선 에리어의 경계역)까지 가는 경우는 IC카드가 6엔 싸진다.한편, 오미야의 1역처, 토려(간선 에리어)까지 가는 경우는 종이의 표가 3엔 싸진다.」등의 예를 소개하고 있다.덧붙여 JR토카이 회사선에 지나치는 경우 등, IC카드를 사용할 수 없는 경우는, 종이의 표만 의 취급이 된다.

역의 운임표에 관해서는, 종래대로, 노선 도상에 종이의 표를 사는 경우의 금액을 표시한다.그 옆에 IC카드 이용시의 읽어 바꾸어 표를 게시하는 것으로 대응한다.
IC카드는 JR여객 6사 전사에서 도입되고 있지만, JR동일본과 같게 대도시권을 안는 JR토카이나 JR서일본은, 종래대로의 균일 운임을 채용한다고 발표하고 있다.
http://www.jreast.co.jp/press/2013/20131209.pdf